Mudanças entre as edições de "Dataverse:Instalação"

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= UBUNTU 20.04 =
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= Instalação do Dataverse =
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A instalação do Dataverse pode ser feito de duas maneiras, uma pelo arquivo pré-copilado dvinstall.zip e outra pelo código fonte.
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Para cada versão do Dataverse têm arquivos (scripts em Python) que facilitam a configuração.
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Antes de instalar o Dataverse é importante definir o Identificador persistente HANDLE ou DOI.
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A documentação para instalação do Dataverse está disponível em inglês em [[https://guides.dataverse.org/en/latest/installation/index.html https://guides.dataverse.org/en/latest/installation/index.html]]
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Checklist para testes do Dataverse
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* Configuração de memória
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* Enviar e-mail
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* Registro de DOI
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** Checkar configurações
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** [https://doi.test.datacite.org/ Datacite Fabrica Teste]
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** [https://doi.datacite.org/repositories/gdcc.rnp Datacote Fabrica]
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* Registro de Handle
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** [https://www.handle.net/index.html Handle.net]
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* Arquivo Zipados
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== Instalações de Dataverse ==
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Visualize as instalações de referência do [[Dataverse:Instalações pelo mundo]]
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== Instalações ==
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=== UBUNTU 20.04 ===
  
 
=Pre-requisitos=
 
=Pre-requisitos=
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  apt-get upgrade
 
  apt-get upgrade
 
  E
 
  E
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  apt-get install openjdk-8-jdk
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  apt-get install openjdk-11-jdk
 
  apt-get install lynx #navegador texto, testar o SOLR
 
  apt-get install lynx #navegador texto, testar o SOLR
 
  apt-get install postgresql postgresql-contrib
 
  apt-get install postgresql postgresql-contrib
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  sudo update-alternatives --config java
 
  sudo update-alternatives --config java
  
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Para melhor funcionamento escolha a versão 1.8
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Para melhor funcionamento escolha a versão 11
  
 
Baixe o dvinstall.zip e o v4.11.tar.gz preferencialmente no diretório /tmp
 
Baixe o dvinstall.zip e o v4.11.tar.gz preferencialmente no diretório /tmp
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−
<h2>Iniciando o Payara durante o Boot do sistema</h2>
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== Iniciando o Payara durante o Boot do sistema ==
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O script de instalação do dataverse vai iniciar o Glassfish se necessario, mas você pode preferir o seguinte script para rodar o Glassfish automaticamente durante o
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cp /home/dataverse/dataverse-5.3/doc/sphinx-guides/source/_static/installation/files/etc/systemd/payara.service /etc/systemd/system
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[[Script Payara]]
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systemctl daemon-reload
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systemctl start payara.service
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systemctl enable payrar.service
  
 
=Postgresql=
 
=Postgresql=
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apt install postgresql
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[[Dataverse:Postgress]]
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pico /etc/postgresql/10/main/postgresql.conf
 
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Alterar a linha
 
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#listen_addresses = 'localhost'
 
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    para
 
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listen_addresses = '*' libera para todas as conexões
 
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nano /etc/postgresql/10/main/pg_hba.conf
 
−
 
 
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Troque
 
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host    all            all            127.0.0.1/32            md5
 
−
por
 
−
host    all            all            127.0.0.1/32            trust
 
−
 
  
 
=Solr=
 
=Solr=
−
 
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[[Dataverse:Solr]]
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Você não deve rodar o Solr como root. Crie um usuario chamado Solr um diretorio no qual instalar o mesmo.
 
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useradd solr
 
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mkdir /usr/local/solr
 
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chown solr:solr /usr/local/solr
 
−
 
 
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su - solr
 
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cd /usr/local/solr
 
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wget https://archive.apache.org/dist/lucene/solr/7.3.0/solr-7.3.0.tgz
 
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tar xvzf solr-7.7.2.tgz
 
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cd solr-7.7.2
 
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cp -r server/solr/configsets/_default server/solr/collection1
 
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Utilizando  o arquivo  "dvinstall.zip" baixado na etapa de pre-requisitos. extraia ele em /tmp se ainda não o tiver feito.  Então copie os arquivos nos seguintes diretórios.
 
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cp /home/dataverse/dvinstall/schema*.xml /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/conf
 
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cp /home/dataverse/dvinstall/solrconfig.xml /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/conf
 
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−
O Dataverse requer uma mudança no jetty.xml que vem junto com o Solr. Edite e aumentando requestHeaderSize de 8192 para 102400
 
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nano /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/etc/jetty.xml
 
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<Set name="requestHeaderSize"><Property name="solr.jetty.request.header.size" default="'''102400'''" /></Set>
 
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O Solr vai avisar sobre precisar aumentar o numero de descritores de arquivos e processos maximos em um ambiente de produção mas ainda vai rodar com os padrões. O dataverse ja aumenta esses padrões para os niveis recomentados ao adicionar a linha ulimit -n 65000 ao script de inicialização, mas para maior eficiencia, coloque o seguinte no arquivo
 
−
 
 
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nano /etc/security/limits.conf
 
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solr soft nproc 65000
 
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solr hard nproc 65000
 
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solr soft nofile 65000
 
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solr hard nofile 65000
 
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Criar a coleção collection1 no Solr
 
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echo "name=collection1" > /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/core.properties
 
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Usando o Solr como servico
 
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cp /tmp/solr.service /etc/systemd/system
 
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systemctl daemon-reload
 
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systemctl start solr.service
 
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systemctl enable solr.service
 
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para que o script seja rodado e ativado durante o boot
 
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=jq=
 
=jq=
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Dentro do diretório do /home/dataverse/
 
Dentro do diretório do /home/dataverse/
  
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cd /home/dataverse/dataverse-5.3/scripts/r/rserve/
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./rserve-setup.sh
 
Dentro da pastar de instalação do arquivo auxliar do Dataverse
 
Dentro da pastar de instalação do arquivo auxliar do Dataverse
  
 
Usando o RSERVE como servico
 
Usando o RSERVE como servico
  
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  cp rserve.service /etc/systemd/system
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  cp rserve.service /etc/systemd/system/.
 
  systemctl daemon-reload
 
  systemctl daemon-reload
 
  systemctl start rserve.service
 
  systemctl start rserve.service
 
  systemctl enable rserve.service
 
  systemctl enable rserve.service
  
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Sendo que <DATAVERSE SOURCE TREE> é o diretorio extraido do arquivo v5.3.tar.gz baixado no inicio junto com os pré-requisitos
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Inclui os paramentos no Domian.xml
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nano /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1/config/domain.xml
  
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<jvm-options>-Ddataverse.rserve.host=localhost</jvm-options>
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<jvm-options>-Ddataverse.rserve.port=6311</jvm-options>
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<jvm-options>-Ddataverse.rserve.user=rserve</jvm-options>
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<jvm-options>-Ddataverse.rserve.password=rserve</jvm-options>
  
 
=Dataverse=
 
=Dataverse=

Edição atual tal como às 22h15min de 13 de agosto de 2021

Instalação do Dataverse

A instalação do Dataverse pode ser feito de duas maneiras, uma pelo arquivo pré-copilado dvinstall.zip e outra pelo código fonte. Para cada versão do Dataverse têm arquivos (scripts em Python) que facilitam a configuração.

Antes de instalar o Dataverse é importante definir o Identificador persistente HANDLE ou DOI.

A documentação para instalação do Dataverse está disponível em inglês em [https://guides.dataverse.org/en/latest/installation/index.html]

Checklist para testes do Dataverse

Instalações de Dataverse

Visualize as instalações de referência do Dataverse:Instalações pelo mundo

Instalações

UBUNTU 20.04

Pre-requisitos

Ainda como superusuário 

apt-get update
apt-get upgrade
E
apt-get install openjdk-11-jdk
apt-get install lynx #navegador texto, testar o SOLR
apt-get install postgresql postgresql-contrib
apt-get install apache2
apt-get update

useradd dataverse -m

Selecionar a versão do Java

sudo update-alternatives --config java

Para melhor funcionamento escolha a versão 11

Baixe o dvinstall.zip e o v4.11.tar.gz preferencialmente no diretório /tmp

Instalado 

wget https://github.com/IQSS/dataverse/releases/download/v5.3/dvinstall.zip
unzip dvinstall.zip

Scripts utilitário 

wget https://github.com/IQSS/dataverse/archive/v5.3.tar.gz
tar -xvf v5.3.tar.gz

Payara 5

wget https://s3-eu-west-1.amazonaws.com/payara.fish/Payara+Downloads/5.2020.6/payara-5.2020.6.zip
unzip payara-5.2020.6.zip
mv payara5 /usr/local

Libera o acesso ao usuário dataverse 

chown -R root:root /usr/local/payara5
chown -R dataverse:dataverse /usr/local/payara5/glassfish/lib
chown -R dataverse:dataverse /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1

Mude de -client to -server em <jvm-options>-client</jvm-options> se não tiver alterado. 

nano /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1/config/domain.xml

/usr/local/payara5/bin/asadmin start-domain


Crie os arquivos de Start e Stop 

/usr/local/glassfish4/bin/asadmin stop-domain
/usr/local/glassfish4/bin/asadmin start-domain


Iniciando o Payara durante o Boot do sistema

cp /home/dataverse/dataverse-5.3/doc/sphinx-guides/source/_static/installation/files/etc/systemd/payara.service /etc/systemd/system
systemctl daemon-reload
systemctl start payara.service
systemctl enable payrar.service

Postgresql

Dataverse:Postgress

Solr

Dataverse:Solr

jq

cd /usr/bin
wget http://stedolan.github.io/jq/download/linux64/jq
chmod +x jq
jq --version

ImagiMagick

apt-get install imagemagick

R

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/'
sudo apt update
sudo apt install r-base
sudo apt install libdumbnet1 r-base-dev
sudo -i R

Dentro do R, instale os pacotes 

install.packages("R2HTML", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("rjson", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("DescTools", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("Rserve", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("haven", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )

Rserve

Dentro do diretório do /home/dataverse/ 

cd /home/dataverse/dataverse-5.3/scripts/r/rserve/
./rserve-setup.sh

Dentro da pastar de instalação do arquivo auxliar do Dataverse

Usando o RSERVE como servico 

cp rserve.service /etc/systemd/system/.
systemctl daemon-reload
systemctl start rserve.service
systemctl enable rserve.service

Inclui os paramentos no Domian.xml 

nano /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1/config/domain.xml

<jvm-options>-Ddataverse.rserve.host=localhost</jvm-options>
<jvm-options>-Ddataverse.rserve.port=6311</jvm-options>
<jvm-options>-Ddataverse.rserve.user=rserve</jvm-options>
<jvm-options>-Ddataverse.rserve.password=rserve</jvm-options>

Dataverse

vá para a pasta que foi extraida de dvinstall.zip nos pré-requisitos e rode o script de instalação 

./install

O script vai pedir algumas configurações. Eis os valores padrões de cada opção
Internet Address of your host: localhost
Glassfish Directory: /usr/local/glassfish4
Glassfish User: current user running the installer script
Administrator email address for this Dataverse: (none)
SMTP (mail) server to relay notification messages: localhost
Postgres Server Address: [127.0.0.1]
Postgres Server Port: 5432
Postgres ADMIN password: secret
Name of the Postgres Database: dvndb
Name of the Postgres User: dvnapp
Postgres user password: secret
Remote Solr indexing service: LOCAL
Rserve Server: localhost
Rserve Server Port: 6311
Rserve User Name: rserve
Rserve User Password: rserve
Administration Email address for the installation;


Use as seguintes credenciais para logar:

URL: http://localhost:8080 username: dataverseAdmin password: admin

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