Dataverse:Instalação
Índice
UBUNTU 20.04
Pre-requisitos
Ainda como superusuário
apt-get update apt-get upgrade E apt-get install openjdk-8-jdk apt-get install lynx #navegador texto, testar o SOLR apt-get install postgresql postgresql-contrib apt-get install apache2 apt-get update
useradd dataverse -m
Selecionar a versão do Java
sudo update-alternatives --config java
Para melhor funcionamento escolha a versão 1.8
Baixe o dvinstall.zip e o v4.11.tar.gz preferencialmente no diretório /tmp
Instalado
wget https://github.com/IQSS/dataverse/releases/download/v5.3/dvinstall.zip unzip dvinstall.zip
Scripts utilitário
wget https://github.com/IQSS/dataverse/archive/v5.3.tar.gz tar -xvf v5.3.tar.gz
Payara 5
wget https://s3-eu-west-1.amazonaws.com/payara.fish/Payara+Downloads/5.2020.6/payara-5.2020.6.zip unzip payara-5.2020.6.zip mv payara5 /usr/local
Libera o acesso ao usuário dataverse
chown -R root:root /usr/local/payara5 chown -R dataverse:dataverse /usr/local/payara5/glassfish/lib chown -R dataverse:dataverse /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1
Mude de -client to -server em <jvm-options>-client</jvm-options> se não tiver alterado.
nano /usr/local/payara5/glassfish/domains/domain1/config/domain.xml
/usr/local/payara5/bin/asadmin start-domain
Crie os arquivos de Start e Stop
/usr/local/glassfish4/bin/asadmin stop-domain /usr/local/glassfish4/bin/asadmin start-domain
Iniciando o Payara durante o Boot do sistema
cp /home/dataverse/dataverse-5.3/doc/sphinx-guides/source/_static/installation/files/etc/systemd/payara.service /etc/systemd/system systemctl daemon-reload systemctl start payara.service systemctl enable payrar.service
Postgresql
apt install postgresql pico /etc/postgresql/12/main/postgresql.conf
Alterar a linha
#listen_addresses = 'localhost'
para
listen_addresses = '*' libera para todas as conexões
nano /etc/postgresql/12/main/pg_hba.conf
Troque
host all all 127.0.0.1/32 md5
por
host all all 127.0.0.1/32 trust
Solr
Você não deve rodar o Solr como root. Crie um usuario chamado Solr um diretorio no qual instalar o mesmo.
useradd solr -m mkdir /usr/local/solr chown solr:solr /usr/local/solr
su - solr cd /usr/local/solr wget https://archive.apache.org/dist/lucene/solr/7.7.2/solr-7.7.2.tgz tar xvzf solr-7.7.2.tgz cd solr-7.7.2 cp -r server/solr/configsets/_default server/solr/collection1
Utilizando o arquivo "dvinstall.zip" baixado na etapa de pre-requisitos. extraia ele em /tmp se ainda não o tiver feito. Então copie os arquivos nos seguintes diretórios.
cp /home/dataverse/dvinstall/schema*.xml /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/conf cp /home/dataverse/dvinstall/solrconfig.xml /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/conf
O Dataverse requer uma mudança no jetty.xml que vem junto com o Solr. Edite e aumentando requestHeaderSize de 8192 para 102400
nano /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/etc/jetty.xml
<Set name="requestHeaderSize"><Property name="solr.jetty.request.header.size" default="102400" /></Set>
O Solr vai avisar sobre precisar aumentar o numero de descritores de arquivos e processos maximos em um ambiente de produção mas ainda vai rodar com os padrões. O dataverse ja aumenta esses padrões para os niveis recomentados ao adicionar a linha ulimit -n 65000 ao script de inicialização, mas para maior eficiencia, coloque o seguinte no arquivo
nano /etc/security/limits.conf
solr soft nproc 65000 solr hard nproc 65000 solr soft nofile 65000 solr hard nofile 65000
Criar a coleção collection1 no Solr
echo "name=collection1" > /usr/local/solr/solr-7.7.2/server/solr/collection1/core.properties
Usando o Solr como servico
cp /home/dataverse/dataverse-5.3/doc/sphinx-guides/source/_static/installation/files/etc/systemd/solr.service /etc/systemd/system/. systemctl daemon-reload systemctl start solr.service systemctl enable solr.service
para que o script seja rodado e ativado durante o boot
jq
cd /usr/bin wget http://stedolan.github.io/jq/download/linux64/jq chmod +x jq jq --version
ImagiMagick
apt-get install imagemagick
R
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/' sudo apt update sudo apt install r-base sudo apt install libdumbnet1 r-base-dev sudo -i R
Dentro do R, instale os pacotes
install.packages("R2HTML", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("rjson", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("DescTools", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("Rserve", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
install.packages("haven", repos="https://cloud.r-project.org/", lib="/usr/lib64/R/library" )
Rserve
Dentro do diretório do /home/dataverse/
cd /home/dataverse/dataverse-5.3/scripts/r/rserve/ ./rserve-setup.sh
Dentro da pastar de instalação do arquivo auxliar do Dataverse
Usando o RSERVE como servico
cp rserve.service /etc/systemd/system/. systemctl daemon-reload systemctl start rserve.service systemctl enable rserve.service
Dataverse
vá para a pasta que foi extraida de dvinstall.zip nos pré-requisitos e rode o script de instalação
./install
O script vai pedir algumas configurações. Eis os valores padrões de cada opção
Internet Address of your host: localhost
Glassfish Directory: /usr/local/glassfish4
Glassfish User: current user running the installer script
Administrator email address for this Dataverse: (none)
SMTP (mail) server to relay notification messages: localhost
Postgres Server Address: [127.0.0.1]
Postgres Server Port: 5432
Postgres ADMIN password: secret
Name of the Postgres Database: dvndb
Name of the Postgres User: dvnapp
Postgres user password: secret
Remote Solr indexing service: LOCAL
Rserve Server: localhost
Rserve Server Port: 6311
Rserve User Name: rserve
Rserve User Password: rserve
Administration Email address for the installation;
Use as seguintes credenciais para logar:
URL: http://localhost:8080 username: dataverseAdmin password: admin
